أوضح ديوان المحاسبة الليبي في تقريره السنوي 2017 بأنه قام بفحص عينة ممثلة في كادر جهاز حرس المنشآت النفطية عن مرتبات (1،2،3،4) ومطابقة بيانات الجهاز مع بيانات وزارة مالية الوفاق، وتبين أن الجهاز يصرف في مرتبات أقل مما يتم إحالته إليه من قبل وزارة مالية الوفاق الأمر الذي يشير إلى وجود وظائف وهمية مغطاة بأرقام وطنية بنسبة تتجاوز 15%.
وبين أيضا التقرير بأن 33 موظفاً بالجهاز يتلقون مرتباتهم بدون رقم وطني بمبلغ اجمالي يقدر بـ 48،110 ألف دينار شهرياً، وأن اجمالي المرتبات المحالة للجهاز يتجاوز 2 مليون ونصف المليون دينار، كما يتم صرف مرتبات لـ 1824 موظف ليسوا ضمن القوة العمومية لجهاز لحرس المنشآت النفطية حيث انتهت علاقاتهم الوظيفية بالجهة منهم من فسخ عقده ومنهم من توفي.
